La Secretaría Ejecutiva (SE) fue concebida, en primera instancia, con el nombre de Unidad Técnica de Apoyo (UTA), la cual desempeñaría las funciones que se le solicitó a la OIM asumir, de manera formal, como prestador de servicios secretariales y de apoyo técnico de la CRM. Fue a partir de esta petición que en marzo de 2001 la OIM creó la UTA para suplir las necesidades de la Presidencia Pro-Témpore de manera específica y de la CRM en general. En el año siguiente, durante la VII Conferencia Regional sobre Migración celebrada en Antigua, Guatemala, se le designó con el nombre de Secretaría Técnica de la CRM y durante el Relanzamiento de la CRM en el año 2019, se pasó a denominar Secretaría Ejecutiva. Desde su creación cuenta con la cooperación técnica y el apoyo administrativo de la OIM y el financiamiento de los Países Miembros. Una de las tareas fundamentales de la SE es brindar asistencia a la Presidencia Pro-Témpore en cuanto a la organización y seguimiento de las actividades e iniciativas de la Conferencia.

Por otra parte, la SE recibe directrices generales y supervisión de la Presidencia Pro-Témpore en ejercicio de la CRM, con el propósito de darle seguimiento a los mandatos y directrices emanados de cada reunión y se encarga de asistir a la Presidencia Pro-Témpore en la administración del proceso, incluyendo la coordinación de reuniones y el intercambio de información. La SE está compuesta por un(a) Secretario(a), un(a) especialista en tecnología de información y un(a) asistente. Tiene un presupuesto anual aprobado a nivel Viceministerial, el cual se cubre con los aportes de los Países Miembros con base en una escala de contribuciones predefinida. Funciona como una unidad autónoma dentro de la Oficina Regional de la OIM para Centroamérica y México, localizada en San José, Costa Rica. La OIM brinda además facilidades para la administración de los recursos, adquisiciones y otros tipos de apoyo técnico.

La SE debe mantener un estrecho contacto con los puntos focales de cada país para cooperar con la Presidencia Pro-Témpore en la coordinación general de la Conferencia, incluyendo aspectos de logística de los eventos.

El equipo de la SE está conformado por:
    

       José Eduardo Rojo Oropeza
       Secretario Ejecutivo
       Secretaría Ejecutiva de la Conferencia Regional sobre Migración
       Cel: (506) 8851-1009
       Email: jrojo@iom.int

       Renán Rodas
       Especialista en TI
       Secretaría Ejecutiva de la Conferencia Regional sobre Migración
       Cel: (506) 7118-5097
       Email: rrodas@iom.int

       Marisol Aguilar
       Especialista Técnica
       Secretaría Ejecutiva de la Conferencia Regional sobre Migración
       Cel: (506) 7118-7015
       Email: maaguilar@iom.int